Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	827801	827867	67	64 [0]	[0] 49	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

ACGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGCAA  >  minE/827739‑827800                                                              | acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3391417/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2681067/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:101529/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2739284/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2812233/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2880701/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2943190/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2952684/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3058922/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3061623/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3063130/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3098885/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3311098/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3326182/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3335578/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2685549/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3465488/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:354507/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3597667/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3628454/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:48946/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:572119/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:655044/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:670752/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:698637/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:714915/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:724929/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:760754/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:765328/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:789441/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1425277/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1020251/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1032033/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1033119/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1051569/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1080073/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1194633/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1286315/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1289827/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1371507/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1373333/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1398915/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1402341/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1419103/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2597853/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1450089/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1535736/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2506850/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2414589/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:23730/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2308925/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:224947/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2130849/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1913992/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1884593/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1873414/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1869990/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1857355/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:1638101/62‑1 (MQ=255) acGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCAAGGGCAATTTGcaa  <  1:3609410/62‑1 (MQ=255)  cGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:582666/61‑1 (MQ=255)  cGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:39427/61‑1 (MQ=255)      ttCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:2475949/57‑1 (MQ=255)                   gAATGTTTGACGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGcaa  <  1:3361520/44‑1 (MQ=255)                                                              | ACGACTTCACTCGCTTGCGAATGTTTGAGGGCGTTACTTAATGCCTCACGGGCAATTTGCAA  >  minE/827739‑827800

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑