Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	58926	58935	10	46 [0]	[0] 2	hepA	RNA polymerase‑associated helicase protein

GGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGTT  >  minE/58864‑58925                                                              | ggattggattTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:716924/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:689205/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1008257/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3518593/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3536321/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3586/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3607567/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3640460/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:411302/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:495334/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:603436/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:620631/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:627577/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3499911/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:689280/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:718504/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:772084/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:779934/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:878942/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:906129/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:93678/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:964282/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:994102/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2217920/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1161157/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1244386/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1249718/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1308876/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1356205/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1631985/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1706597/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1776095/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1786062/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1937684/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:1941622/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:34779/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2219834/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:224452/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2415594/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2421464/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2710286/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2745824/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:2840791/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3109624/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:3416734/1‑62 (MQ=255) ggAGTGGAATTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGtt  >  1:589202/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCAGCGCTTCATGTT  >  minE/58864‑58925

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑