Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	59004	59011	8	18 [0]	[0] 47	hepA	RNA polymerase‑associated helicase protein

ATCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGT  >  minE/58943‑59003                                                             | aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:3298106/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:916104/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:75056/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:527578/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:45383/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:386542/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:3547744/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:3358702/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1049756/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:2762814/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1946475/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1910562/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1617699/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1426877/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:139083/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1210104/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGt  <  1:1158556/61‑1 (MQ=255) aTCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGATAATCAGATCGTTGt  <  1:3505330/61‑1 (MQ=255)                                                             | ATCAGATCGTCAAAGCCTTCGGTTTGATCCGGTGAAGCCAGATAGTTAATCAGATCGTTGT  >  minE/58943‑59003

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑