Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	870047	870136	90	72 [0]	[1] 2	topA	DNA topoisomerase I, omega subunit

TAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCAAA  >  minE/869988‑870046                                                           | tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3383852/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:367521/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3613094/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3465987/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:343693/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3425952/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3407255/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:339448/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3390167/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:376579/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3370282/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:33382/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3325127/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3226746/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3164300/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:3106012/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2908635/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2826148/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:6415/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:996765/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:99261/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:913271/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:866177/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:750561/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:70921/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:690493/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:652321/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2650297/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:625852/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:613382/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:601779/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:561962/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:55291/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:524150/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:507315/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:403864/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1292918/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1002572/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:155254/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1552018/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1519123/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:150241/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1408152/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:139048/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1300053/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1713544/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:126118/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1253653/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1217320/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1209867/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1198280/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1173871/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1061502/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1057813/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2185523/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2582696/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2417517/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2403068/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2392414/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2376652/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2298478/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:221006/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1750480/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2092319/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2029358/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:2019932/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1991282/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1861533/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1851226/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1836684/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1781567/1‑59 (MQ=255) tAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTCTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCaaa  >  1:1123098/1‑59 (MQ=255)                                                           | TAGGTAAGGTGAATATGGGTAAAGCTCTTGTCATCGTTGAGTCCCCGGCAAAAGCCAAA  >  minE/869988‑870046

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑