Missing coverage evidence...
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TCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCG  >  minE/875288‑875349                                                              | tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2392796/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:848099/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:738155/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:653918/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:3544788/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:3492571/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:3425301/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:3390297/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:3342256/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:301539/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2942755/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2814004/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2473248/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1008182/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2314555/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2158107/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:2138263/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1947297/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1875584/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:187279/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1803668/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1356563/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:124905/62‑1 (MQ=255) tCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1195094/62‑1 (MQ=255)  cGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCg  <  1:1977946/61‑1 (MQ=255)                                                              | TCGGTTTAGCGTCGTGCCGCCAGGCACAGGCATTTGCCATCAGGTTAACCTCGAATATCTCG  >  minE/875288‑875349

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑