Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	890381	890428	48	32 [0]	[0] 9	ycjD	conserved hypothetical protein

TCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGC  >  minE/890319‑890380                                                              | ttaccacAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3346432/3‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2948135/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:797268/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:775927/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:775919/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:684720/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:549557/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:525171/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:51020/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:481472/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3595903/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3444434/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3107962/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3082355/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3034724/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:3031527/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:1003294/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2805567/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2694008/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2681515/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2633393/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2632049/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2560855/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2557736/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2500608/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2281993/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2274011/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:2261948/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:1664098/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:1542667/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:1515418/1‑62 (MQ=255) tCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACcggc  >  1:1073305/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCACCACAACAGCTATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGC  >  minE/890319‑890380

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑