Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	899403	899628	226	36 [0]	[0] 4	[pspD]	[pspD]

CGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAC  >  minE/899342‑899402                                                             | cGCTGTCAACAGGCCGGTCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2845713/61‑1 (MQ=255) cGCTGTCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAATCTGGTAc  <  1:3096095/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:3153991/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1136505/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2521628/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2683319/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2875711/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2881490/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2920789/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2453544/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:3376869/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:342267/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:3549339/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:427413/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:536159/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:561420/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:925937/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:98582/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1793296/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1251997/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1275750/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1299094/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1367123/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1385811/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1475656/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1698499/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2241996/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1841047/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:1870/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2097771/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2144061/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2186214/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2201255/61‑1 (MQ=255) cGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2227896/61‑1 (MQ=255)  gCTGGCTACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:2135889/60‑1 (MQ=255)             gCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAc  <  1:82704/49‑1 (MQ=255)                                                             | CGCTGGCAACAGGCCGGGCAAAAGGTAAAGCCTGGTTTCAAATTAGCAGGCAAGCTGGTAC  >  minE/899342‑899402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑