Missing coverage evidence...
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GCAGCATGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGA  >  minE/907691‑907751                                                             | gcagcaTGTAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1988693/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:3346992/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2723794/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2866725/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:295810/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:297260/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:3060793/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:3248253/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:3277129/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2606360/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:3399110/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:40375/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:455092/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:585137/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:782735/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:850710/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:872551/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:920267/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1708243/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1094023/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1202190/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1210552/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1338450/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:166779/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1668893/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1770964/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1789606/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2240252/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:226190/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2285647/61‑1 (MQ=255) gcagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2327479/61‑1 (MQ=255)  cagcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:2495581/60‑1 (MQ=255)    gcaTGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:713714/58‑1 (MQ=255)       tGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1641884/55‑1 (MQ=255)                         aCGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGa  <  1:1027944/37‑1 (MQ=255)                                                             | GCAGCATGGAAGCCTTTATCAATCACGTACAGGGCAAGCCCGTGATGATAGCCGACGCCGA  >  minE/907691‑907751

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑