Missing coverage evidence...
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ATAGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCT  >  minE/918773‑918834                                                              | ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2885181/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2386635/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2471563/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2473543/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2541503/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2596222/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2616859/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2655626/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2666842/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2672151/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2292135/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2956273/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:3293291/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:3300535/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:3401785/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:3645237/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:608014/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:742909/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:897607/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1803457/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1156053/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1235477/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:128244/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1335898/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1338805/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1440050/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1455963/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1537855/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2263793/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:180695/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1992367/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1993247/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2061581/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2081441/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2116409/62‑1 (MQ=255) ataGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2206762/62‑1 (MQ=255)  taGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1302416/61‑1 (MQ=255)  taGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2290730/61‑1 (MQ=255)  taGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:2290193/61‑1 (MQ=255)    gTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:3349541/59‑1 (MQ=255)      tAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:3068414/57‑1 (MQ=255)      tAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:327053/57‑1 (MQ=255)               acCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1861880/48‑1 (MQ=255)                          gCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCt  <  1:1125630/37‑1 (MQ=255)                                                              | ATAGTTAACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTTGCGCT  >  minE/918773‑918834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑