Missing coverage evidence...
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AATGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCGTGG  >  minE/924413‑924474                                                              | aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2571834/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:762779/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:401521/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:390300/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:368225/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:3618735/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:3587764/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:3457351/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:3201384/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:315871/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:302193/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2853390/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2658235/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2589861/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1010323/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2061021/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1036025/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1086817/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1461758/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1466059/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1685067/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:172712/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1735486/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:1861848/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2420650/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2369389/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2377674/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2384224/62‑1 (MQ=255) aaTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2407409/62‑1 (MQ=255)  aTGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2411554/61‑1 (MQ=255)           cTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:3091490/52‑1 (MQ=255)                          tAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCgtgg  <  1:2756452/37‑1 (MQ=255)                                                              | AATGGAAAACCTATATCGATAGCCGTAACACCGGCAATTTTGATGTTATCCGCGCCTCGTGG  >  minE/924413‑924474

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑