Missing coverage evidence...
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TTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCC  >  minE/972932‑972992                                                             | ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:2423931/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:695316/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:3645932/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:331910/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:3298770/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:3118094/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:3117618/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:305756/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:3008890/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:2874723/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:2850903/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1069039/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:2279987/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:2121456/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:2061580/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1803147/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1417038/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1255566/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1099875/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1093229/1‑61 (MQ=255) ttCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGcc  >  1:1071057/1‑61 (MQ=255)                                                             | TTCCGATCTCGGTGCGTCGTTTCTGATGCCCGCCATCACCGCCGTGGTGCTTGGCGGGGCC  >  minE/972932‑972992

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑