Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	973439	973508	70	42 [0]	[0] 5	lsrB	AI2 transporter

CAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCT  >  minE/973376‑973438                                                               | caaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGAC‑GGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3430168/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGAGCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2596522/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGTGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2835822/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3319300/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2889516/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3012229/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3092605/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3149323/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3181575/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3213449/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3240653/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2696641/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3324650/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3394540/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3493060/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:3503401/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:524153/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:664372/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:87684/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:981217/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1441703/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1097427/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1135402/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1223598/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1297039/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1303461/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1332835/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:134600/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2648340/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1488125/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1678466/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:178740/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2116372/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:219808/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2209845/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2376397/62‑1 (MQ=255)  aaGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2496256/62‑1 (MQ=255)   aGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:492968/61‑1 (MQ=255)   aGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:904269/61‑1 (MQ=255)        gTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1365540/56‑1 (MQ=255)         tAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:1034683/55‑1 (MQ=255)                   ggCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCt  <  1:2566618/45‑1 (MQ=255)                                                               | CAAGCGGGTAAAGAGCTGGGCGTTGATGTGACCTACGACGGGCCGACAGAACCCAGTGTTTCT  >  minE/973376‑973438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑