Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	986904	986928	25	52 [0]	[0] 60	ynfE	oxidoreductase subunit

CGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAGG  >  minE/986843‑986903                                                             | cgTGAAATTGGCACAGCAATACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1967095/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAACCCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1871995/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCGAgg  >  1:3538765/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3366968/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2489162/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2557002/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2599087/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2603669/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2660230/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2851915/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2912604/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2940746/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3081281/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3227456/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3290382/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2319444/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3377567/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3417246/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3497143/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:3633007/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:385643/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:659363/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:693046/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:708581/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:775266/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:830934/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:83450/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1746164/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1158653/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1159900/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1165272/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1166808/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1167824/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:12439/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:130084/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1424650/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1502072/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1529615/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1718227/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2404937/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1797275/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1808921/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1828190/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1835949/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2083199/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2147325/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:216793/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2188547/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2189240/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:2229578/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:1156329/1‑61 (MQ=255) cgTGAAATTGGCACAGCAAAACCCACTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAgg  >  1:157505/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGCTGGGGGCCACAACGCCAGG  >  minE/986843‑986903

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑