Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1007623	1007630	8	36 [0]	[0] 20	ydgI	predicted arginine/ornithine antiporter transporter

CGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGT  >  minE/1007562‑1007622                                                             | cGTTTTTTCGGCGTTATGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGTTGGt  <  1:151258/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTAGGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:955334/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2776987/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2772625/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2933028/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:3029522/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:3039035/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:3059979/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:3213069/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:3417095/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:3490462/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:578587/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:598308/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:603350/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:67054/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:794548/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:826833/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:906120/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:927063/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2125740/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1224258/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1293618/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1582878/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1642886/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1691910/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2121592/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1145681/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2456956/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2498180/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2601949/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2605451/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2646456/61‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACAAGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:1578715/61‑1 (MQ=255)  gTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:131701/60‑1 (MQ=255)                   cTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2748354/43‑1 (MQ=255)                       tttAC‑GACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGt  <  1:2310558/38‑1 (MQ=37)                                                             | CGTTTTTTCCGCGTTAAGCTTTTTTACGGACACGCCGGAATTGCGCCTGTTTGGCGATGGT  >  minE/1007562‑1007622

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑