Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1008038	1008043	6	38 [0]	[0] 6	ydgI	predicted arginine/ornithine antiporter transporter

CGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGAAA  >  minE/1007976‑1008037                                                              | cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3476341/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2959866/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3002975/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3067188/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3082140/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3169519/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3203063/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3300568/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3380918/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3409124/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2950027/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3521151/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3529662/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:3569544/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:366203/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:380098/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:593169/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:844124/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:88016/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2136363/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1065128/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:107705/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1304786/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1331218/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1480394/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1607480/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1640544/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1994816/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:201370/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:1012798/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2213091/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2234174/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:232/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2738861/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2766023/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2834038/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2874064/1‑62 (MQ=255) cGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGaaa  >  1:2940106/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGTTTACTTGCTGGTAACGCTGCTTTCGCTGGGTGTGGTGGCACGTCCTGAACTGGCTGAAA  >  minE/1007976‑1008037

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑