Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1023838	1023865	28	67 [0]	[0] 45	uidA/uidR	beta‑D‑glucuronidase/DNA‑binding transcriptional repressor

TAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGCACACA  >  minE/1023777‑1023837                                                             | tAAGATAATTATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3106167/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3461433/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2886098/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3014776/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3018840/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3064849/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3111762/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3193593/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3209372/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3249625/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3284012/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3307582/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3357772/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3370198/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:337078/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3414333/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2841461/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3469758/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3478516/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3568507/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:36106/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:3630767/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:42412/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:430281/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:58562/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:641028/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:659152/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:755359/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:817307/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:874976/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:982914/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:987124/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1566937/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2803063/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1847391/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1816804/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1812380/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1667873/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:166142/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1652491/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1601850/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1903824/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:155486/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:148292/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1430753/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1273367/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1226738/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1138684/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1083664/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2152594/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2748007/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2704643/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2633354/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2615189/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2568954/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2556787/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2454466/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2415597/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2352018/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2303541/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2189838/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2189100/61‑1 (MQ=255) tAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2098040/61‑1 (MQ=255)  aaGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:758657/60‑1 (MQ=255)    gATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1117502/58‑1 (MQ=255)           ataCTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:2903930/51‑1 (MQ=255)                    aaCCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGcacaca  <  1:1000994/42‑1 (MQ=255)                                                             | TAAGATAATAATACTGGTCAACCTTTAATCTGATTAGTTAACCAATTCTGTGTTGCACACA  >  minE/1023777‑1023837

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑