Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1041111	1041116	6	41 [0]	[0] 10	ydgR	predicted transporter

TCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAC  >  minE/1041049‑1041110                                                              | tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:359973/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2524937/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2556309/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2723080/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2732732/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:3030281/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:3144779/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:3200175/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:3284989/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:3332797/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:341156/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2364850/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:420016/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:572912/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:594117/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:604641/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:635568/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:677299/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:789835/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:831139/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:990100/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1878200/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1064156/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1085038/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1132478/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1299573/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1311653/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1374404/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1374539/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1381463/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1545823/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1031510/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1930276/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:1939398/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2108338/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2123412/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2186546/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2187852/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2270129/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2274485/1‑62 (MQ=255) tCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAc  >  1:2305331/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCGCCTTCTGCCAACGCTGGGTTAAACAGTACGGTTCAAAACCAGACTTCGAGCCTATCAAC  >  minE/1041049‑1041110

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑