Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1046331	1046438	108	38 [0]	[0] 15	ydhH	conserved hypothetical protein

GCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAC  >  minE/1046270‑1046330                                                             | gCGTTCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:496847/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3604251/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3297890/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3314984/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3461341/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3467174/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3474717/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3491885/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3504958/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3509142/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3541050/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3180959/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:686116/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:77801/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:797212/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:849837/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:854134/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:864476/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:951293/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2184725/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1220055/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1499201/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1710483/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:171397/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1769922/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1891609/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1953193/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1975008/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:1000726/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2267861/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2375516/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2524030/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2528310/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2567159/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2730194/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3143273/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:3170871/1‑61 (MQ=255) gCGTCCGACAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAc  >  1:2043492/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCGTCCGCCAGGCAAGCCAGGCGAAAGCCAATGCTTCCATGTCATCGCCACTAATGCCAAC  >  minE/1046270‑1046330

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑