Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	82100	82116	17	44 [0]	[0] 85	murD	UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine:D‑glutamate ligase

CAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGAA  >  minE/82039‑82099                                                             | cattCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2528490/58‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3152357/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:233408/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1011915/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2453721/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2584943/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2672219/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2837122/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:290935/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2967617/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3040965/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2392040/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3412105/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3453305/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3492780/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3497802/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:476790/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:57428/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:65787/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:823057/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:989565/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1852506/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1095007/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1107821/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1331841/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1334374/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1336245/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1378350/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:139652/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1558648/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:1726935/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:182741/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:194236/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2008775/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2127978/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2129248/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2158197/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2177820/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2211757/61‑1 (MQ=255) cAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:225575/61‑1 (MQ=255)  aGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:3543836/60‑1 (MQ=255)   gTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2849672/59‑1 (MQ=255)      ccGGTATAGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2737216/56‑1 (MQ=255)              gCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGaa  <  1:2258835/48‑1 (MQ=255)                                                             | CAGTCCCGGTATTGCACTGGCGCATCCATCCTTAAGCGCTGCCGCTGATGCCGGAATCGAA  >  minE/82039‑82099

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑