Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1065549	1065559	11	46 [0]	[0] 36	purR	DNA‑binding transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding

TTGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATAAA  >  minE/1065490‑1065548                                                           | ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:328305/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1011534/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:2268164/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:230485/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:2592125/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:2604601/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:2823077/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:292046/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3118437/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3177273/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3197964/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3237054/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:2052370/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3327044/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3405881/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3555262/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:385615/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:479903/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:638622/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:705817/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:717634/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:813313/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:818223/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:156433/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1057526/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1131334/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1197601/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1205970/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1272817/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1284484/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1356159/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1454948/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1532297/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1545390/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:2012090/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1574315/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1581590/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1591948/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1780935/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1825795/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1887011/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1927361/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1965798/59‑1 (MQ=255) ttGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1992725/59‑1 (MQ=255)             aGGAGCTGAAGTTAGTGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:3545680/47‑1 (MQ=255)                aGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATaaa  <  1:1800839/44‑1 (MQ=255)                                                           | TTGCGATTTTGCAGGAGCTGAAGTTAGGGTCTGGAGTGAAATGGAATGGCAACAATAAA  >  minE/1065490‑1065548

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑