Missing coverage evidence...
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CTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCCAGC  >  minE/1072344‑1072403                                                            | cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:272499/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:73279/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:393284/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:3537327/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:34350/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:3405075/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:317644/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:3064118/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:3031187/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2941106/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:1190745/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2676054/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2621425/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2552431/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2515644/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2332892/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:2206476/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:1342884/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:1330682/60‑1 (MQ=255) cTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGGCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:1851950/60‑1 (MQ=255)  ttGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:3399826/59‑1 (MQ=255)  ttGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCcagc  <  1:1608307/59‑1 (MQ=255)                                                            | CTTGCCAAGCGGCTATATTCTGGCACTGACCGATCTGGTCGTTGAACCTATGGGGCCAGC  >  minE/1072344‑1072403

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑