Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1072501	1072503	3	31 [0]	[0] 30	mdtK	multidrug efflux system transporter

CGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATT  >  minE/1072439‑1072500                                                              | cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2092164/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:980101/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:540480/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:3598788/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:358623/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:3393089/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:3210809/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2872873/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2634425/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2625347/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2557898/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2420668/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2420056/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2257700/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2216395/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:220347/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1085465/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2087891/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:200758/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:2003323/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1993909/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1957929/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1884203/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1665919/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1650291/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1544418/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1417495/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1345932/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1320472/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1302491/1‑62 (MQ=255) cGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCAtt  >  1:1261920/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGCAGCCATTATGATGATGTTGCGTATGCGGTTCCTGCAACGTCTGCCGTCAGCCATCATT  >  minE/1072439‑1072500

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑