Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1091804	1091816	13	76 [0]	[0] 30	sufA	Fe‑S cluster assembly protein

TTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGA  >  minE/1091743‑1091803                                                             | ttcTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1856816/61‑1 (MQ=255) ttcTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:525680/61‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2857491/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3195733/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3128970/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3078224/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3046397/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:298637/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2907160/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2906580/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2895559/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3202316/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2850546/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2759687/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2736509/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2679032/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2645298/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2502476/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1093348/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:246297/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3567392/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:977809/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:917979/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:888958/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:824761/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:801373/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:656051/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:502072/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:415290/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:247225/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3556945/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3499815/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3446717/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3412761/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3387383/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3352527/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3221039/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1592437/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1847719/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2446067/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1748674/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1729347/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1712294/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1699698/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1650140/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1617865/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1790461/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1567308/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1558784/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:15224/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1359718/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1325878/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1315843/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1211472/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:114687/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2098311/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2428499/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2410756/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2408467/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2294171/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:229365/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2262405/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2168914/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1882514/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2078747/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2074391/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:2059203/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1976191/46‑1 (MQ=255)                ttGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1925675/46‑1 (MQ=255)                 tgtgAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACTAAATCGa  <  1:2491246/45‑1 (MQ=255)                 tgtgAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3552893/45‑1 (MQ=255)                 tgtgAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:3459386/45‑1 (MQ=255)                 tgtgAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:238865/45‑1 (MQ=255)                  gtgAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:826948/44‑1 (MQ=255)                  gtgAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1952468/44‑1 (MQ=255)                       aTTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGa  <  1:1671466/39‑1 (MQ=255)                                                             | TTCTGGGCTTTAGGGTTGTGAAATTTGAATATCTGATTAAGTCCTTCACGAACGAAATCGA  >  minE/1091743‑1091803

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑