Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1093542	1093566	25	59 [0]	[0] 5	ydiJ	predicted FAD‑linked oxidoreductase

TTTTCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAC  >  minE/1093480‑1093541                                                              | ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCACCCCACGCTGAc  >  1:1324519/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:522535/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2455890/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2519568/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:260946/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2984957/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3073051/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3214556/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3280872/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3348744/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3522085/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3553790/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3625037/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3649570/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:417185/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:46017/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:241869/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:557055/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:58911/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:680760/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:763842/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:803518/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:823120/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:849532/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:914314/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:923336/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:923734/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:938621/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:939722/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1640438/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:111159/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1186420/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1201742/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1247067/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1257112/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1324510/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1350771/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1373309/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1416749/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1442397/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:149169/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1508062/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1554422/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1636391/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:10256/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1762728/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1795364/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1824925/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1825329/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:1919578/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2062897/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2063190/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2100915/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2295694/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2358435/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2377085/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCACTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:2055104/1‑62 (MQ=255) ttttCATGGTTTTTCGCTTAATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3430459/1‑62 (MQ=255) ttttCATCGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAc  >  1:3629092/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTTTCATGGTTTTTCGCTTCATGTCCGTAAGTCCCTGCCATGCCGCAGCAACCCACGCTGAC  >  minE/1093480‑1093541

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑