Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1107191	1107193	3	65 [0]	[0] 38	ydiP/ydiQ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator/conserved hypothetical protein

GAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGATT  >  minE/1107129‑1107190                                                              | gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCATGAtt  <  1:2603641/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3631699/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3638493/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3506982/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3479119/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3097898/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3063300/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3055996/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3044765/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:3030527/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2926311/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2908167/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2896258/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2807549/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2728820/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2684012/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2618120/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:257975/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:384179/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:388259/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:42722/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:458561/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:482156/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:485986/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:514777/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:556281/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:583732/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:691005/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:727250/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:803574/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:923879/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:961954/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:97477/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1983106/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1065859/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1139940/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1238690/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1285681/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1286116/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1298566/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1369479/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1372979/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1373281/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1490037/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1567723/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:16002/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1732746/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1904934/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1944520/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1019814/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:1997551/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2052360/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2068452/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2151401/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2183026/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2227873/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2236756/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2261008/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2330110/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2455597/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2465086/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2550722/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2557161/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:2569837/62‑1 (MQ=255) gAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGAtt  <  1:257919/62‑1 (MQ=255)                                                              | GAATAACTATATTGCCGCAAATTGCACTTTTGTTTTAGCGATCGCATTTTTTTTGCAAGATT  >  minE/1107129‑1107190

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑