Missing coverage evidence...
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CCCCTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACGG  >  minE/1129230‑1129290                                                             | ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCGGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1079038/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:446469/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1043056/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:421472/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:361995/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:3420071/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:33616/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:3356027/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:2902041/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:25293/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:2188462/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:2134989/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1862219/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1809672/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1792687/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1689212/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1636376/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1187670/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1183065/61‑1 (MQ=255) ccccTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATAGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:1971428/61‑1 (MQ=255)      ggTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACgg  <  1:2085990/56‑1 (MQ=255)                                                             | CCCCTGGTTGAAAATTTGTACGTGACCCGGGCAGTTCATCGGCTTAATGCAGTATTCACGG  >  minE/1129230‑1129290

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑