Missing coverage evidence...
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TATAACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGAA  >  minE/1132680‑1132741                                                              | tataTCCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2242299/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACgaagaa  <  1:2037664/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:340803/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2644674/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2650329/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2721819/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2810605/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3169966/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3183046/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3183933/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3368743/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3392114/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2558001/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3409047/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:341691/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:3601294/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:516454/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:534806/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:605390/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:823113/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:856029/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:940279/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:985882/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1874683/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1266233/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1437460/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1488035/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1640370/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1722330/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1780555/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1825244/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:184061/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1867688/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:120828/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2017089/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2096459/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2283552/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2327235/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2432090/62‑1 (MQ=255) tataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2507995/62‑1 (MQ=255)  ataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:1959814/61‑1 (MQ=255)  ataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:566649/61‑1 (MQ=255)  ataACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2659414/61‑1 (MQ=255)                    tatatatCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2158910/43‑1 (MQ=255)                        tatCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGaa  <  1:2510885/39‑1 (MQ=255)                                                              | TATAACCAGCTATTTACGATATATATCGATACATAATTTTATTTTTTTCATAAAACGCAGAA  >  minE/1132680‑1132741

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑