Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1142498	1142719	222	40 [0]	[0] 62	katE	hydroperoxidase HPII(III)

AACCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTG  >  minE/1142438‑1142497                                                            | aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGTATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1844822/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3248818/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2467113/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2554164/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2559926/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:261180/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2695880/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2888486/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3103957/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3142191/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2292317/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3457621/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3465932/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3494416/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3527040/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3542051/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3587864/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:688768/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:905631/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:991163/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1571095/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1352752/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1443373/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1448115/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1458601/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:123242/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1518944/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1016445/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1562784/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1577410/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1587913/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1806771/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1956867/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2084647/60‑1 (MQ=255) aaCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1041221/60‑1 (MQ=255)  aCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:3352/59‑1 (MQ=255)  aCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1163325/59‑1 (MQ=255)  aCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1772997/59‑1 (MQ=255)  aCCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:2221798/59‑1 (MQ=255)                        cTCGTTTGGGATGAAGCAGAAAAACTCACCGGACGTg  <  1:1464310/37‑1 (MQ=255)                                                            | AACCACTGGCAGGTAAAGCCTCACTCGTTTGGGATGAAGCACAAAAACTCACCGGACGTG  >  minE/1142438‑1142497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑