Missing coverage evidence...
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CAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGC  >  minE/1151431‑1151492                                                              | cAATCCCGACGGATCTGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1280060/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3639166/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2842587/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:293778/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2995183/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3058049/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3166573/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3232719/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3306171/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3352348/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3391038/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3452243/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3469701/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3519521/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2801677/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:448527/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:585349/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:610299/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:74822/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:85195/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:90144/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:90262/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:929042/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:942206/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:949545/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1985371/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1131373/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1186715/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1474913/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1554772/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1648498/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1685980/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1784935/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1822603/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1844561/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1121580/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2141331/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:217542/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2192928/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2241168/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2278748/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2553470/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2611049/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2690558/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2754299/62‑1 (MQ=255)  aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2286757/61‑1 (MQ=255)  aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1292324/61‑1 (MQ=255)  aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:269434/61‑1 (MQ=255)   aTCCCGACGGATCAGCTTGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:6201/60‑1 (MQ=255)    tCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCAGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:185636/59‑1 (MQ=255)         aCGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3131844/54‑1 (MQ=255)                                                              | CAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGC  >  minE/1151431‑1151492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑