Missing coverage evidence...
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TTTGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGCC  >  minE/1160125‑1160178                                                      | tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2819577/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:956767/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:835225/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:774231/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:673259/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:405268/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:405257/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:3580714/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:3475030/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:3397420/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:3314831/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:3228204/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2845534/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:1191251/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2713995/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2589709/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2424465/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2413484/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2298930/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2186447/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:2114731/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:187385/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:1766652/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:1674846/1‑54 (MQ=255) tttGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGcc  >  1:121520/1‑54 (MQ=255)                                                      | TTTGTCTCTTTTAATATCAACGGCCTGCGCGCCAGACCTCACCAGCTTGAAGCC  >  minE/1160125‑1160178

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑