Missing coverage evidence...
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CCTTTCATTTGGCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTCA  >  minE/1170655‑1170716                                                              | ccTTTCATTTGTCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:465557/62‑1 (MQ=255) ccTTTCATTTGGCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:3550834/62‑1 (MQ=255) ccTTTCATTTGGCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:3009525/62‑1 (MQ=255) ccTTTCATTTGGCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2495589/62‑1 (MQ=255) ccTTTCATTTGGCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2861993/62‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2837106/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:953578/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:919841/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:817606/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:462083/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:3404977/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:3380189/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:3308691/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:3031533/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2885765/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1156788/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2368020/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2175470/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:2086266/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:206439/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1986202/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:192848/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1740330/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1661458/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1515440/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1422534/40‑1 (MQ=255)                       aTTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1376230/40‑1 (MQ=255)                       aTTAGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTca  <  1:1167917/40‑1 (MQ=255)                                                              | CCTTTCATTTGGCGGCAGTCTTATTCGCCCGGAAGCTACCGGCTACGGTCTGGTTTATTTCA  >  minE/1170655‑1170716

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑