Missing coverage evidence...
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TATAAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGA  >  minE/1177149‑1177210                                                              | tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2570131/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:821543/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:701833/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:646323/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:552782/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:549833/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3522799/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3487123/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3419251/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3319442/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3287638/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3197039/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3122469/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2883000/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2875307/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2772362/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2124764/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:102387/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:1025273/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:146493/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:151008/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:1527944/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:1824707/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:18319/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2135907/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:218981/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2240096/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2268162/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2275822/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2495246/62‑1 (MQ=255) tataAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:2552245/62‑1 (MQ=255)                gAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:3431329/47‑1 (MQ=255)                   ccGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGa  <  1:1021153/44‑1 (MQ=255)                                                              | TATAAATCTGCCGTTGAACCGTTTATTCGTGATGATATGTCACCGGCAGCCCGCGAAGCTGA  >  minE/1177149‑1177210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑