Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1188338	1188340	3	86 [0]	[0] 38	yeaI	predicted diguanylate cyclase

TTATCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTG  >  minE/1188279‑1188337                                                           | ttatCATGTGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1182072/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACTATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:986926/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3132030/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2349178/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3087187/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3079394/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3037773/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2990933/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2987927/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2917652/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2871287/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2794412/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2732842/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:269816/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2696425/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:265907/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2613811/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2580201/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2540381/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1002140/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2349373/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2439597/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3590669/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:960669/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:908672/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:795254/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:733922/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:726784/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:631325/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:61433/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:52461/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:441887/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3196855/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3537165/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3502374/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3412669/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:340492/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3399177/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3377790/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:335812/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:322342/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1267683/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1526939/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:151551/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2314336/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1434645/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1432797/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1416232/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1410022/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:139700/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1384673/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1439585/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1112624/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1086431/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1072034/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1068323/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1050500/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1035537/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1012378/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1006330/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2017383/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2297544/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2278601/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2176159/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2134715/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2107168/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2097621/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2069714/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:2042133/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:156468/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1947593/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1926648/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1737402/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1717452/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1700429/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1668484/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1619166/59‑1 (MQ=255) ttatCATGCGCACACGATTAGCCACCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3014014/59‑1 (MQ=255)  tatCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1300891/58‑1 (MQ=255)   atCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3614808/57‑1 (MQ=255)   atCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1204019/57‑1 (MQ=255)       tGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:1043649/53‑1 (MQ=255)       tGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3221223/53‑1 (MQ=255)              acGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3493283/46‑1 (MQ=255)                 aTTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:3511912/43‑1 (MQ=255)                 aTTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTg  <  1:691911/43‑1 (MQ=255)                                                           | TTATCATGCGCACACGATTAGCCAGCGAACTATGGCCGTTAATAGCATTATTATGTCTG  >  minE/1188279‑1188337

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑