Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1210211	1210261	51	43 [0]	[0] 24	rrmA	23S rRNA m1G745 methyltransferase

CTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGC  >  minE/1210149‑1210210                                                              | ctGTACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2340273/62‑1 (MQ=255) ctGTACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2320372/62‑1 (MQ=255) ctGGAGGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:486095/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:541704/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2578941/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:3468194/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:3486884/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:356956/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:529868/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:204955/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:651607/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1744678/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:78534/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:878829/62‑1 (MQ=255) ctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:996848/62‑1 (MQ=255) ctGCACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1415628/62‑1 (MQ=255)    taCGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:998916/58‑1 (MQ=255)    gACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2203710/59‑1 (MQ=255)     aCGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:363571/58‑1 (MQ=255)      cGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1325542/57‑1 (MQ=255)      cGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1039548/57‑1 (MQ=255)        cACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1241215/55‑1 (MQ=255)        cACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:734584/55‑1 (MQ=255)        cACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1571718/55‑1 (MQ=255)        cACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1729056/55‑1 (MQ=255)        cACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1914961/55‑1 (MQ=255)         aCTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1871074/54‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2750745/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1640299/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:1839166/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:230589/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2345866/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2496430/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2851226/53‑1 (MQ=255)          cTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2691333/53‑1 (MQ=255)           ttCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCTGAGGTGAATATTAAAGTCCTTCTGGc  <  1:2522613/52‑1 (MQ=255)           ttCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2187849/52‑1 (MQ=255)           ttCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:2175900/52‑1 (MQ=255)           ttCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:3441861/52‑1 (MQ=255)           ttCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:766187/52‑1 (MQ=255)           ttCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:868412/52‑1 (MQ=255)            tCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc  <  1:3365498/51‑1 (MQ=255)                    taataaGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGACTGGc  <  1:1572726/43‑1 (MQ=255)                                                              | CTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGC  >  minE/1210149‑1210210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑