Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1216328	1216394	67	10 [0]	[0] 75	htpX	predicted endopeptidase

CGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGCCATCCA  >  minE/1216266‑1216327                                                              | cGTTCTCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:3118873/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:1038617/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:1714953/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:2433105/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:2975175/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:3160308/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:3214631/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:3334339/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:3441789/62‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGccatcca  <  1:3532919/62‑1 (MQ=255)                                                              | CGTTCCCTTTCGTTACGCGGTTGCTCGATCACTTCCCCGCCAACAGATCGTAATGCCATCCA  >  minE/1216266‑1216327

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑