Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1222269	1222367	99	76 [0]	[0] 36	yebT	conserved hypothetical protein

CGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTA  >  minE/1222211‑1222268                                                          | cGAGGCGGGAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:976521/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3070847/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2454285/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3069320/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2975634/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:294564/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2908062/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2856254/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2845212/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:27672/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2739399/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2666945/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:264413/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2638189/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2633159/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2613597/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2585241/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2529253/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2488140/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2429440/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3600659/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:885387/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:880673/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:852088/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:687690/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:561829/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:516841/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:470385/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:369890/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:308405/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3538399/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3502183/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:348763/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3280115/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3240619/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3213826/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3136097/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:3097866/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1296370/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1598713/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1508047/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1447111/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1440256/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1418033/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1372714/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1358660/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:132689/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1303839/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1634983/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1280184/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1268273/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1227202/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1224661/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1195155/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:117355/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1157322/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1137637/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2037511/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2331763/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:232584/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2287822/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2282383/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2237655/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2130455/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2116735/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2074853/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1108815/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:2035386/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1976850/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1973586/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1882343/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1876172/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1787431/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:172837/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGta  >  1:1693932/1‑58 (MQ=255) cGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCCta  >  1:2251519/1‑58 (MQ=255)                                                          | CGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTA  >  minE/1222211‑1222268

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑