Missing coverage evidence...
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AGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCG  >  minE/1279185‑1279245                                                             | aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2015555/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:835205/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:630680/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:490197/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:373890/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:3269443/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:3231511/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:322183/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:260025/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2502159/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2462949/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2259296/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2164633/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1015708/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2006989/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1874577/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1849428/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:167956/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1467523/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1437085/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1428535/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1276002/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:120944/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1185538/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1149083/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1087968/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTGGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:1145895/1‑61 (MQ=255) aGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACATTGGCGGTACACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCg  >  1:2649711/1‑61 (MQ=255)                                                             | AGCTGGCTACCCGCCTGGCCGCACCTTGGCGGTAAACTGGTCTATGAACAGTATTATGGCG  >  minE/1279185‑1279245

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑