Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1288068	1288216	149	12 [0]	[0] 36	shiA	shikimate transporter

GCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGT  >  minE/1288006‑1288067                                                              | gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:2129456/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:2136498/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:2202725/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:2206913/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:2219665/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:2288378/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:3188240/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:3403073/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:654101/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:718414/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:873623/62‑1 (MQ=255)   tGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGt  <  1:17937/60‑1 (MQ=255)                                                              | GCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGT  >  minE/1288006‑1288067

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑