Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1294977	1295015	39	43 [0]	[0] 11	nac	DNA‑binding transcriptional dual regulator

AAGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCG  >  minE/1294916‑1294976                                                             | aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGTAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:747030/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGGAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2159000/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCACTCGAGACTTGCCCCg  <  1:3317929/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:3316461/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2583916/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2777853/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2853036/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2874816/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2944673/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2983740/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:3008609/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:3121396/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:3168317/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2568672/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:3394030/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:3429837/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:402122/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:465607/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:664547/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:804699/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:846478/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1663994/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1190164/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1446063/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1485253/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:153671/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1567348/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:161752/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1159972/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1681846/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1727748/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1762118/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1945328/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2003915/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2145040/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2245251/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2312933/61‑1 (MQ=255) aaGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:2545739/61‑1 (MQ=255)  aGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:359818/60‑1 (MQ=255)  aGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1487953/60‑1 (MQ=255)         ggTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCTAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1677585/53‑1 (MQ=255)             atggatgACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:1623913/49‑1 (MQ=255)                           ggTTCCTGGTGTAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCg  <  1:751254/35‑1 (MQ=255)                                                             | AAGGGCATGGTGATGGATGACGCAGCGGTTCCTGGTGCAAAGCCAATCGAGACTTGCCCCG  >  minE/1294916‑1294976

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑