Missing coverage evidence...
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GCGATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGTGCTG  >  minE/1315501‑1315540                                        | gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:2959862/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3460092/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3401432/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3364407/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3293794/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3274277/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3263063/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3172389/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3142105/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:2968374/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:3591055/40‑1 (MQ=255) gcgATTGCAGGATTACGCCGCGCAGGGTGCCGAAGtgctg  <  1:291870/40‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑