Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	110145	110190	46	62 [0]	[0] 10	aceE	pyruvate dehydrogenase, decarboxylase component E1, thiamin‑binding

AACTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCT  >  minE/110102‑110144                                           | aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCTCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3535228/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3598043/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2879367/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1112117/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2934763/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2938163/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3003241/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3170996/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3217207/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:326709/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3272375/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3282788/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3288111/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3359559/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3419980/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:28876/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3626167/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:388324/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:404012/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:440781/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:48136/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:486478/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:601224/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:652626/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:723638/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:728187/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:81829/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:961385/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:988598/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:994362/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1992422/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1143359/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:117932/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1308230/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1437360/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1458999/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1581746/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1702187/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1778453/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1796980/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1837474/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1906738/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:192020/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2775904/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2053984/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2078169/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:226545/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2695179/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2286170/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2338859/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2375383/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2442595/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2680210/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2643970/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2488061/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2504955/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2593484/43‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:2595040/43‑1 (MQ=255) aaCACCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:3477939/43‑1 (MQ=255)  aCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:489642/42‑1 (MQ=255)  aCTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:400406/42‑1 (MQ=255)   cTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCt  <  1:1765041/41‑1 (MQ=255)                                           | AACTCCGCGCGTTCCGTATATCGCTCAGGTGATGAACGACGCT  >  minE/110102‑110144

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑