Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1344375	1344456	82	76 [0]	[0] 40	wzb	protein‑tyrosine phosphatase

CACCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTCACA  >  minE/1344324‑1344374                                                   | cacGGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:675262/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGTGGATTTcaca  <  1:3187920/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTctca  <  1:2654751/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2748430/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:100085/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:277829/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2780473/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2860492/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2895358/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2929041/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2932921/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2941148/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2990715/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2994233/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3002224/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3084244/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3134260/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3173229/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3228039/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3485454/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:959460/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:849288/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:801914/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:675261/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:634347/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:604689/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:530553/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:476642/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2745996/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3484119/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3435410/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:335693/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3339279/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3263598/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3258691/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:3235077/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1579798/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1753073/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1741864/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2643981/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1651429/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1647106/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1611088/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1604006/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1588629/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1727346/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1535815/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1496503/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1350748/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1319305/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1305008/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1223502/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1144860/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1010817/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1768994/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2587510/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2458082/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2440262/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2315832/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2292041/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2257974/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2224374/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2182202/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2180504/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2108216/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1923396/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1889918/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1805779/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1762918/51‑1 (MQ=255) cacCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATC‑GGGATTTcaca  <  1:3586213/50‑1 (MQ=255)  acCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:2104730/50‑1 (MQ=255)  acCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:1131232/50‑1 (MQ=255)        gCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:365061/44‑1 (MQ=255)        gCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:453975/44‑1 (MQ=255)        gCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:841689/44‑1 (MQ=255)        gCAAACGGTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTcaca  <  1:18267/44‑1 (MQ=255)                                                   | CACCGCTGCAAACGTTTCCCGGCTTTTGCGATACGGATCGGGGATTTCACA  >  minE/1344324‑1344374

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑