Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1353350	1353358	9	36 [0]	[0] 32	thiM	hydoxyethylthiazole kinase

CCAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCTT  >  minE/1353298‑1353349                                                    | ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:470577/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:1085913/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3394166/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3489095/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3522574/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:352474/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3629566/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:387497/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:44733/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3282753/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:486019/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:524763/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:564198/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:701859/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:782798/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:802325/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:815436/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:928971/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2422585/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:1394227/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:1440428/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:1521992/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:1706532/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:1947090/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2239803/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2307378/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3281168/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2535481/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2665521/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2787667/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2925747/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2992567/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3133339/52‑1 (MQ=255) ccAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3181108/52‑1 (MQ=255)  cAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:2168694/51‑1 (MQ=255)  cAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCtt  <  1:3409210/51‑1 (MQ=255)                                                    | CCAACGTTAATCAACAAGGCACTGGCGATAGCCGCAAACTGACTGGCCTCTT  >  minE/1353298‑1353349

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑