Missing coverage evidence...
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AATCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGCC  >  minE/1403113‑1403174                                                              | aaTCGCAAAAGTTGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2680016/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:566616/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3014456/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:304089/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3173151/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3177126/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3284861/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3423453/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3517342/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:3565645/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:363490/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:480577/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:502143/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2969844/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:635010/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:650222/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:662610/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:683006/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:750306/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:775533/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:788944/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:805065/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:895785/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:93277/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:977699/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2935586/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1105534/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1121431/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1370357/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1580130/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1638747/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1682691/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1781378/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:179852/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1840364/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1872410/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2121579/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2340571/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2387782/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2461464/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2475834/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2489380/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2554944/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:266180/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2669349/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:2842054/62‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1013667/62‑1 (MQ=255)   tCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGcc  <  1:1054678/60‑1 (MQ=255)                                                              | AATCGCAAAAGATGATTGTGCCGCTGACTCAGCACCTGTTTGAGTTAATTGCCCGCGATGCC  >  minE/1403113‑1403174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑