Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1411354	1411369	16	34 [0]	[0] 16	rsuA	16S rRNA pseudouridylate 516 synthase

AATACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGC  >  minE/1411292‑1411353                                                              | aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3068251/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:866473/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:817882/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:796854/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:688616/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:639832/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:614720/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:511530/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:417427/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3587996/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:350801/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3390070/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3254421/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3151701/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3112125/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:113066/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:22785/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:12657/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:1468161/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:1630702/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:1682370/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:303037/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2338639/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2399685/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2425733/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2468689/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2754950/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2798685/62‑1 (MQ=255) aaTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTAAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:1669914/62‑1 (MQ=255)  aTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:3475236/61‑1 (MQ=255)  aTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:471117/61‑1 (MQ=255)  aTACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:1534272/61‑1 (MQ=255)   tACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:2197842/60‑1 (MQ=255)                          aGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGc  <  1:236664/37‑1 (MQ=255)                                                              | AATACCGCCAATACGTTCACGATGCAGCTCAACCACGTGGTTACCCACGGCGGCGAACATGC  >  minE/1411292‑1411353

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑