Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1444840	1444844	5	5 [0]	[0] 7	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

TTGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAG  >  minE/1444799‑1444839                                         | ttGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAg  >  1:1435360/1‑41 (MQ=255) ttGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAg  >  1:1748045/1‑41 (MQ=255) ttGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAg  >  1:1831250/1‑41 (MQ=255) ttGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAg  >  1:3397432/1‑41 (MQ=255) ttGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAg  >  1:939379/1‑41 (MQ=255)                                         | TTGACGTCGCTAAGCACGATATCAATATGATTCTTGCTAAG  >  minE/1444799‑1444839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑