Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1445646	1445650	5	14 [0]	[0] 54	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

TCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAC  >  minE/1445585‑1445645                                                             | tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:1215324/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:1313195/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:1639065/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:1822704/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:1835319/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:1898579/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:198764/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:2290244/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:2576853/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:2852415/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:3235453/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:3252187/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:3468819/1‑61 (MQ=255) tCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAc  >  1:846849/1‑61 (MQ=255)                                                             | TCGCCATCCGCGCGAACATGCAAAACTATACAGCCGGTATCGGTGAATTTTATGGCGTTAC  >  minE/1445585‑1445645

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑