Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1446541	1446556	16	50 [0]	[0] 15	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

GGATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAG  >  minE/1446480‑1446540                                                             | ggATCACCATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1249107/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGTACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2458349/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:399962/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2717865/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2845369/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3011845/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3041154/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3101344/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3224449/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3293044/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3325182/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3353883/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3511336/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3646382/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1080348/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:537899/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:539814/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:5564/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:581490/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:628363/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:64764/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:821756/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:919315/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:981676/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:98440/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2638177/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1070325/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1146521/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:115329/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1240810/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1448231/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:154784/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1605982/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1675042/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1778546/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1822573/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1882446/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:1890848/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2089855/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2178196/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2455948/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2514580/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2577328/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2586454/61‑1 (MQ=255) ggATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2711138/61‑1 (MQ=255)  gATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2247103/60‑1 (MQ=255)     cAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:3259240/57‑1 (MQ=255)          tGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACAAGATGCTTAg  <  1:867972/52‑1 (MQ=255)            cGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:2549508/50‑1 (MQ=255)                 gCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAg  <  1:988586/45‑1 (MQ=255)                                                             | GGATCAACATGCGAATGCGTTCCAGCACCTTATCAACCGGCACCGAATACACGATGCTTAG  >  minE/1446480‑1446540

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑