Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1448446	1448530	85	38 [0]	[1] 40	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

TAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGT  >  minE/1448383‑1448445                                                               | tAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCG‑CAGGGTGATGt  <  1:2229980/62‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3328150/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2702166/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2812846/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1132886/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2944719/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3129233/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:322635/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3281871/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2826392/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3393957/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3533831/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:477424/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:573339/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:70465/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:868559/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:879283/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1671509/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1215802/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1394581/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1430506/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1434783/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1466373/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1597751/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1777531/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:1927208/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2193003/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2236882/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2272612/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2403926/60‑1 (MQ=255)    cGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTCACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2097401/60‑1 (MQ=255)    cGATCTAATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:666615/60‑1 (MQ=255)     gATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2549004/59‑1 (MQ=255)     gATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:2912876/59‑1 (MQ=255)     gATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:808892/59‑1 (MQ=255)      aTCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3435424/58‑1 (MQ=255)         tGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3496480/55‑1 (MQ=255)                 gAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGt  <  1:3358367/47‑1 (MQ=255)                                                               | TAACGATCTGATTATTGAAAACGCTGCCGATGGCGTCATTGCCATTGACCGCCAGGGTGATGT  >  minE/1448383‑1448445

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑