Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1449093	1449183	91	65 [0]	[0] 38	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

GGTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGC  >  minE/1449031‑1449092                                                              | ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCTATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:826897/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTACCGCCGATCGTGAACTGc  <  1:100308/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTACCGCCGATCGTGAACTGc  <  1:95987/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3384695/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3594872/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3335197/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3276992/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3107262/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3048682/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3032061/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2954927/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2940158/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2933299/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2796956/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2787225/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2779902/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2674675/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3434159/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2662549/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3607177/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3641650/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:426475/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:435209/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:448674/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:579222/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:673943/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:82634/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:859825/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:889423/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:919519/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:997616/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1691529/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1044006/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1080107/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1091637/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1141487/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1186504/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1269132/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:127083/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1395317/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1461164/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1576197/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:160738/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2555747/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:175477/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2095113/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2541828/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2288541/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2228190/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2198977/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1764656/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2042774/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1961022/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1954231/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1937779/62‑1 (MQ=255) ggTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1765868/62‑1 (MQ=255)  gTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1436911/61‑1 (MQ=255)  gTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:217653/61‑1 (MQ=255)  gTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1796546/61‑1 (MQ=255)  gTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:3439195/61‑1 (MQ=255)  gTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:936249/61‑1 (MQ=255)  gTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:2418829/61‑1 (MQ=255)          cATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:900860/53‑1 (MQ=255)                     tGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1218898/42‑1 (MQ=255)                           aTGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGc  <  1:1606741/36‑1 (MQ=255)                                                              | GGTCGACTTCATAAGCGAACTGGATAATGAATTAAGCCCGATTAACGCCGATCGTGAACTGC  >  minE/1449031‑1449092

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑